AI kan hjälpa forskare att undersöka ögonsjukdom hos häst

Sofia Mikko, forskare och docent vid institutionen för husdjurens biovetenskaper vid SLU, Sveriges lantbruksuniversitet, leder projektet som fått medel från Stiftelsen Hästforskning och Agria forskningsfond. Hon och hennes kollegor från Sverige, Belgien och Tyskland undersöker den genetiska bakgrunden till mikroftalmi hos hästar. En sjukdom som gör att föl kan födas med ögon som inte är färdigutvecklade, eller att fölet föds utan ett eller båda ögonen.

– Vi kommer att undersöka genetiken hos föl med och utan mikroftalmi för att hitta den orsakande genetiska faktorn och i framtiden erbjuda ett genetiskt test, säger Sofia Mikko i ett pressmeddelande från Agria djurförsäkring.

Viktigt att föra statistik

Studien koncentrerar sig främst på varmblodiga ridhästar, men mikroftalmi förekommer i flera hästraser. Forskarna menar därför att det är viktigt att uppfödare rapporterar in sådana fall till sina avelsorganisationer för att kunna förstå defektens utbredning och ärftlighet.

Genom att undersöka sekvensdata och information om härstamning från både hingstar och ston med avkomma som har mikroftalmi kan forskarna få veta mer. Under forskningsprojektets första år kommer man fokusera på insamling av material såsom semin, samt ögon- och blodprover från kliniska fall. När dessa sedan undersökts för genetiska varianter kommer maskinlärningsanalyser att påbörjas.

– Vi kombinerar konventionell bioinformatik med maskininlärning för att hantera stora datamängder som är svåra att analysera med vanliga statistiska metoder. Målet är att förstå den annorlunda genetiken bakom mikroftalmi, säger Sofia Mikko.